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東京都江東区

お仕事コード:advagt-2150

バイオインフォマティクスエンジニア/NGSデータ解析・解析パイプライン開発

バイオインフォマティクスエンジニア/NGSデータ解析・解析パイプライン開発人材紹介

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オススメポイント
<企業の特徴>
Varinos株式会社は、不妊治療・生殖医療領域に特化し、ゲノム解析技術を活用した遺伝子関連検査サービスを展開する臨床検査会社です。
代表的なサービスとして、子宮内の細菌叢を解析する「子宮内フローラ検査」や、体外受精・顕微授精後の胚の染色体を着床前に評価する「着床前ゲノム検査(PGT-A)」などを提供しています。

同社の特徴は、研究成果を基礎研究で終わらせず、「実際に医療現場で利用される検査」へつなげること。研究開発から検査法開発、性能評価、臨床検査への導入まで一貫して取り組んでいます。
生殖医療という専門性の高い領域にフォーカスし、ゲノム解析・分子生物学の技術を用いて、まだ十分な検査手段が確立されていない医療課題に挑戦している企業です。


<ポジションの特徴>
自分が構築した解析パイプラインやアルゴリズムが、研究成果として終わるのではなく、実際の臨床検査となり、医師の診断・治療判断や患者様の治療選択につながっていく。
そんな、バイオインフォマティクスの技術を医療価値へ直接つなげられるポジションです。

Varinos株式会社では、不妊症や着床不全、流産など、現在も十分な検査手段が確立されていない生殖医療領域を中心に、ゲノム解析技術を用いた新しい臨床検査の開発を進めています。

今回募集するのは、研究開発本部におけるNGSデータ解析・バイオインフォマティクス領域の中核人材です。
既存データを解析するだけではなく、目的に応じた解析手法の選定から、パイプライン設計、性能評価、標準化、解析基盤の改善まで幅広く担当します。
さらに将来的には、研究開発本部全体の解析技術をリードし、新たな解析基盤やアルゴリズムの開発、技術ロードマップの策定、メンバー育成にも関わっていただくことを期待しています。

これまで培ってきたNGS解析やバイオインフォマティクスの専門性を、次の検査・次の医療へつなげていきたい方に、ぜひ知っていただきたいポジションです。

https://job.brexaadvan.com/cgi-bin/jobsearch/research/search/index.cgi?c=zoom&pk=30357

バイオインフォマティクスエンジニア/NGSデータ解析・解析パイプライン開発

給与・待遇 年収 6,000,000円 ~ 12,000,000円 (交通費支給あり)
想定年収:600万円~1,200万円 ※業務手当(固定残業代45時間分)を含む
※前職の給与額を考慮し、本人の経験その他に応じて決定します。

月給:50万円~100万円
 - 基本給:36万9,942円~73万9,884円
 - 固定残業代:13万58円~26万116円(月45時間分)
※月給は年収を12分割した金額を支給いたします。

交通費:実費または、1か月分の通勤定期代を支給(非課税限度額の範囲)
時間外労働手当:実残業と深夜手当が固定残業手当を超える場合は差額を支給
団体保険、社内表彰制度、e-ラーニング受講制度
勤務地 住所:東京都江東区
りんかい線「東京テレポート」駅/ゆりかもめ「台場」駅(徒歩6~8分)
仕事内容 【職務内容】
研究開発本部において、NGSデータ解析およびバイオインフォマティクス基盤の設計・構築・運用を担っていただきます。
マイクロバイオーム解析、変異検出、定量解析など、各プロジェクトの目的に応じた解析手法を選定・検証し、再現性・拡張性を備えたパイプラインとして整備します。
研究者、ラボメンバー、品質・検査関連部門などと連携しながら、探索研究から性能評価、臨床実装を見据えた開発までを解析面から支援するポジションです。

具体的な職務内容
・NGS解析パイプラインの設計、構築、改善および運用
・マイクロバイオーム解析、変異検出、定量解析等に関する解析手法の選定・検証
・新規検査・研究開発プロジェクトにおける解析計画の立案、データ解析、結果解釈
・解析結果の妥当性評価、可視化、レポーティング
・性能評価、統計解析、菌量・構成比等の定量的評価に関する設計支援
・解析コード、ワークフロー、データ処理手順、関連文書の整備
・解析環境・データ管理方法の改善、および再現性・効率性を高める仕組みづくり
・研究開発チームへの技術助言、解析知見の共有、メンバー育成への協力
・必要に応じた論文・学会情報の調査、外部パートナーとの技術的な連携

【本職種の魅力】
・研究開発から臨床検査の提供までを一貫して担う環境で、解析技術を実際の医療価値へつなげられます。
・解析の実行にとどまらず、パイプライン設計、手法選定、評価設計、解析基盤の整備まで幅広く関われます。
・生殖医療、マイクロバイオーム、ゲノム検査など、社会的意義の高いテーマに横断的に携われます。
・探索フェーズの研究から性能評価、臨床実装を見据えた開発まで、成果が形になる過程を経験できます。
・研究開発本部の解析技術をリードする立場として、技術方針や開発の進め方に主体的に提案できます。
・事業・研究開発の拡大に合わせて、解析組織や技術基盤づくりの初期段階から関与できます。

【職務内容の比重】
プロジェクトの状況により変動しますが、入社当初は以下を目安とします。
解析パイプラインの設計・構築・運用 40%
解析基盤の標準化・文書化・品質向上 25%
研究開発プロジェクトへの解析参画 20%
技術共有・レビュー・メンバー育成 15%
勤務時間・残業 09:00~18:00(実働 8 時間)
休憩: 1時間
フレックスタイム制あり
休日 完全週休2日制(土日祝)、夏季休暇、慶弔休暇、年末年始 等 年間休日120日
対象となる方 【必要とされる学歴など】
バイオインフォマティクス、生命情報科学、統計学、情報科学、生命科学、医学・薬学等の関連分野における修士号以上、または同等の実務経験

【必要とされる知識、スキル】
・バイオインフォマティクス、生命情報科学、統計学、情報科学、生命科学、医学・薬学等の関連分野における修士号以上、または同等の実務経験
・NGSデータ解析に関する実務経験または研究経験
・Linux環境での解析経験
・Python、R、Shell等を用いたデータ処理・解析スクリプトの作成経験
・解析パイプラインまたはワークフローの構築・改善経験
・統計解析の基礎知識、および解析結果を適切に解釈・説明する力
・日本語で関係者と円滑にコミュニケーションを取り、技術的な内容を整理・説明できる方

【歓迎される知識、スキル】
・マイクロバイオーム解析、メタゲノム解析、16S rRNA解析等の経験
・変異検出、CNV解析、RNA-seq、エピゲノム解析、シングルセル解析等の経験
・臨床検査、臨床研究、医療機器、製薬・診断薬開発等の規制産業における経験
・検査・研究開発における性能評価、解析バリデーション、統計設計の経験
・解析パイプラインの自動化・運用改善、または再現性の高い解析実行環境の構築経験
 (Nextflow、Snakemake、Docker等の利用経験をお持ちの方は歓迎)
・クラウド環境を活用したデータ解析基盤の構築・運用経験
・SQL等を用いたデータベースの利用経験
・論文執筆、学会発表、特許出願、共同研究等の経験
・英語論文・技術文書を日常的に読解し、業務へ活用できる方
・後輩・チームメンバーへの技術指導、コードレビュー、解析レビューの経験
業界 医薬品・医療機器

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