基軸とする大規模ゲノム改変技術を支えるバイオインフォマティクス研究員人材紹介

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オススメポイント

東工大発のベンチャー企業
独自の大規模ゲノム改変を可能にする技術
Geno-Writing™を用いた
新規有用水酸化細菌や新規治療用細胞などの研究開発を行っています。

https://logomix.bio/ja

https://job.brexaadvan.com/cgi-bin/jobsearch/research/search/index.cgi?c=zoom&pk=26113

基軸とする大規模ゲノム改変技術を支えるバイオインフォマティクス研究員

給与・待遇	年収 5,000,000円～ 11,000,000円 (交通費支給あり) 年俸制（固定残業手当41時間分を含む）雇用形態：契約社員 ※有期契約社員（1年）→　1年後に双方良ければ正社員登用予定 ※同社ではCore Valuesへのフィットを大切にしており、1年目は有期雇用契約としています。Core Valuesに共感するメンバーが集まることで、チームは強くなり、それがLogomixの成長の原動力となると考えています。 ※有期契約期間の待遇は、正社員と同様。
勤務地	住所：神奈川県横浜市緑区東急田園都市線　すずかけ台駅（東急田園都市線　すずかけ台駅　徒歩9分）
仕事内容	株式会社Logomixはゲノム編集技術プラットフォームであるGeno-Writing™をベースに、ヒトやバクテリアの創薬・高機能化・物質生産に取り組む合成生物学ベンチャー企業です。同社はパートナーである大手企業との共同研究や自社研究において様々な大規模ゲノム改変細胞を作製しておりますが、ゲノム編集技術の正確性を検証する目的や細胞の表現型を解析する上で次世代シークエンサー（NGS）解析が重要な技術です。同社が行っている様々なNGS解析を中心としてバイオインフォマティクス業務をご担当いただきます。・Quality evaluation of genome-edited cells using Whole Genome Sequence analysis 　(analysis of fastq.gz read data). ・RNA-seq analysis, pathway analysis, scRNA-seq analysis, ATAC-seq analysis, 　and Perturb-seq analysis targeting human cells. ・Optimization of genome design using machine learning, deep learning, and large language models. ・Building and fine-tuning a transformer-based biological foundation model. ・Utilization and management of AWS cloud servers. ・Utilization of lab automation (automated cell culture system). ■想定される業務内容・Whole Genome Sequence解析によるゲノム編集細胞の品質検査（fastq.gzリードデータの解析）・ヒト細胞を対象としたRNA-seq解析/パスウェイ解析/scRNA-seq解析/ATAC-seq解析/Perturb-seq解析・機械学習・深層学習・大規模言語モデルによるゲノムデザインの最適化・トランスフォーマーベースの生物基盤モデルの構築やファインチューニング・AWSクラウドサーバーの利用・運用・ラボオートメーション（自動細胞培養装置）の活用
勤務時間・残業	09:00～18:00（実働 8 時間）休憩： 1時間裁量労働制（専門業務型） 9～18時を基本とし、本人の裁量に委ねるみなし労働時間 8時間 / 日
休日	完全週休2日制（土日祝）※年間休日122日
対象となる方	・AI/AIエージェントツールを活用したコーディングおよびソフトウェア開発の実務経験・ヒトの細胞・試料を対象としたバイオインフォマティクス研究プロジェクトにおいて、　実験計画から最終的な解析までを一貫して管理した経験・ヒトの生データ、特に全ゲノムシーケンス (WGS) およびRNA-seqデータセットの高度な解析経験・Linux、Bashなどのコマンドライン環境における高い習熟度・プログラミングスキル: 　　必須: PythonまたはRいずれかでの高度なプログラミングスキル　　歓迎: シェルスクリプト、C++、Rust、JavaScript/TypeScript、SQL 　　(MySQL/PostgreSQL) の開発経験【歓迎】・AWS上のデータ操作・バイオインフォマティクス解析の経験・システム/インフラエンジニアの実務経験 (AWSクラウドサーバー・オンプレサーバーの保守など) ・機械学習/深層学習/LLM等の開発/MLOpsの経験・TOEICスコア700点以上の英語力・最低三年間の関連業務経験求める人物像・次世代の細胞治療開発の創出に共に挑んでくれる方・チームでの協調性がある方・失敗や残念なことも報告/連絡/相談できる方
業界	化学